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5900f49a1000cf542c50ffac | 問題 300: タンパク質の折り畳み | 5 | 301954 | problem-300-protein-folding |
--description--
非常に単純化すれば、タンパク質は疎水性要素 (H) と極性要素 (P) で構成される文字列と考えることができます。例えば、HHPPHHHPHHPH です。
この問題ではタンパク質の方向が重要であり、例えば HPP は PPH と区別されます。 したがって、n
個の要素で構成される相異なるタンパク質は 2^n
種類存在します。
自然界では、これらの文字列は常に H-H 接点の数ができるだけ多くなるように折り畳まれています。その方がエネルギー面で有利だからです。
その結果、H 要素は内側に蓄積し、P 要素は外側に蓄積する傾向があります。
自然のタンパク質はもちろん三次元で折り畳まれていますが、ここでは二次元で折り畳まれるタンパク質のみを考えます。
下図は、上の例のタンパク質を折り畳む 2 通りの方法を示しています (赤い点は H-H 接点)。

左側の折り畳みは H-H 接点が 6つしかないため、自然にこの形になることはあり得ないでしょう。 一方、右側の折り畳みは H-H 接点が 9 つあり、この文字列には最適です。
文字列のいずれの位置にも H 要素と P 要素が同じ確率で存在すると仮定すると、長さ 8 の無作為なタンパク質文字列の最適な折り畳みにおいて、H-H 接点の平均数は \frac{850}{2^8} = 3.3203125
になります。
長さ 15 の無作為なタンパク質文字列の最適な折り畳みにおいて、H-H 接点の平均数はいくつですか。 回答は、厳密な結果に対して適宜小数位を使用すること。
--hints--
proteinFolding()
は 8.0540771484375
を返す必要があります。
assert.strictEqual(proteinFolding(), 8.0540771484375);
--seed--
--seed-contents--
function proteinFolding() {
return true;
}
proteinFolding();
--solutions--
// solution required